O Contrato de Associação EURATOM/IST possui os seguintes Orgãos de Gestão:

Steering Committee

O Steering Committee (SC) é constituído por três representantes do IST (o Presidente do IST, o Presidente da Fundação para a Ciência e Tecnologia, e um Prof. nomeado pelo Presidente do IST e por três representantes da EURATOM. O SC reune uma ou duas vezes por ano e tem as seguintes competências principais:

- Nomear e demitir o Responsável pela Unidade de Investigação;

- Aprovar os programas de trabalho, pessoal, orçamentos e relatórios de actividades e contas;

- Aprovar os planos de Mobilidade e os respectivos relatórios;

- Aprovar os Acordos de Colaboração da Associação com quaisquer outras Entidades, nacionais ou estrangeiras.

Responsável pela Unidade de Investigação

O Responsável pela Unidade de Investigação é nomeado pelo Steering Committee, sob proposta do Instituto Superior Técnico. Compete-lhe:

- Assegurar a gestão corrente do Contrato de Associação;

- Implementar as decisões do Steering Committee;

- Submeter os programas de trabalho, pessoal, orçamentos e relatórios de actividades e contas ao Steering Committee.